Les refuges sont des habitats dans lesquels des organismes se mettent à l'abri durant une perturbation (p. ex. crue ou sécheresse). Étant donné qu'ils présentent des conditions physico-chimiques moins sévères, les refuges permettent aux organismes de résister à une perturbation. Bien qu'ils jouent des rôles écologiques importants, peu d'études leur sont consacrées et ils sont souvent négligés dans la gestion pratique (p. ex. revitalisation des eaux). S'appuyant sur des descriptions d'expérience de terrain et de laboratoire, le présent chapitre illustre la structure et la fonction des refuges en situation de crue, en mettant l’accent sur le rôle du régime sédimentaire dans la mise à disposition d'un refuge.