Boden ist ein Habitat, das eine grosse Vielfalt an Mikroorganismen, d. h. Bakterien, Archaeen, Pilzen und Protisten, beherbergt. Wir wissen, dass diese Kleinstlebewesen für eine Vielzahl spezifischer Bodenfunktionen verantwortlich sind. Im Rahmen des Biodiversitätsmonitorings der Schweiz haben wir an 255 Standorten die Diversität der Bodenbakterien und -pilze untersucht. Insgesamt wurden 109 693 Bakterien- und 28 085 Pilztaxa gefunden, wobei etwa ²/₃ der Bakterien- und ¹/₃ der Pilztaxa einer Gattung und der Rest nur einer höheren taxonomischen Klasse zugeordnet werden konnte. Die verschiedenen Landnutzungstypen unterschieden sich signifikant in Vielfalt und Struktur ihrer Bakterien- und Pilzgemeinschaften. Innerhalb des Waldes waren z. B. Pilzgemeinschaften signifikant vom Waldtyp und Bakteriengemeinschaften am stärksten vom pH des Bodens bestimmt. Unsere erste systematische Erhebung von Bakterien und Pilzen in Schweizer Böden zeigte eine immense und dem Lebensraum angepasste mikrobielle Diversität, deren umfassende funktionelle Bedeutung wir erst beginnen zu verstehen.

Soil harbours an enormous diversity of soil microorganisms, including bacteria, archaea, fungi and protists. Further, soil microorganisms are involved in a large number of important soil functions. Taking advantage of the "Biodiversity Monitoring of Switzerland", bacterial and fungal communities were assessed in soils at 255 sites. In total, 109 693 bacterial and 28 085 fungal taxa were detected. Only one third of the fungal and two thirds of the bacterial taxa were classified at the genus level, revealing a high number of undescribed taxa. Land-use types differed in their richness and structure of bacterial and fungal communities. Within forests fungal communities differed among forest types, while bacterial communities were most strongly associated to pH. Our first systematic assessment of soil microorganisms revealed highly diverse communities, which are adapted to their habitat. But, we have only started to understand their functions.